Йота-варіант SARS-CoV-2
| Йота-варіант SARS-CoV-2 | |
| Офіційна назва | англ. Iota (31 травня 2021)[1] |
|---|---|
| Названо на честь | йота |
| Дата відкриття (винаходу) | листопад 2020[1] |
| Місце відкриття | Нью-Йорк і США[1] |
 Йота-варіант SARS-CoV-2 у Вікісховищі | |
Йота-варіант,[2] також відомий як лінія B.1.526, є одним із варіантів SARS-CoV-2, вірусу, що викликає COVID-19. Вперше його виявили в Нью-Йорку в листопаді 2020 року. Варіант з’явився з двома помітними мутаціями: спайкова мутація E484K, яка може допомогти вірусу уникнути антитіл, і мутація S477N, яка може допомогти вірусу міцніше зв’язуватися з клітинами людини.
До лютого 2021 року він швидко поширився в регіоні Нью-Йорка і становив приблизно одну з чотирьох вірусних послідовностей.[3][4] Станом на 11 квітня 2021 року цей варіант був виявлений щонайменше у 48 штатах США та 18 країнах.[5][6]
Згідно зі спрощеною схемою найменування, запропонованою Всесвітньою організацією охорони здоров’я, B.1.526 позначено як йота-варіант і вважається варіантом, що викликає інтерес (VOI), але ще не варіантом, що викликає занепокоєння.[7]
Геном Йота (B.1.526) містить такі амінокислотні мутації, усі з яких містяться в коді спайкового білка вірусу: L5F, T95I, D253G, E484K, D614G та A701V.[8]
-
Амінокислотні мутації варіанту SARS-CoV-2 Йота нанесені на карту геному SARS-CoV-2 з акцентом на спайку.
Збільшення варіанту Йота було зафіксовано дослідниками з Каліфорнійського технологічного інституту шляхом сканування на наявність мутацій у базі даних, відомій як GISAID, глобальна наукова ініціатива, яка задокументувала понад 700 000 геномних послідовностей SARS-CoV-2.[9][10]
Частка випадків у США, представлених варіантом Iota, різко знизилася до кінця липня 2021 року, оскільки варіант Delta став домінуючим.[11]
- Штами SARS-CoV-2: Cluster 5, Альфа, Бета, Гамма, Дельта, Епсилон, Зета, Тета, Ета, Каппа, Лямбда, М'ю, Омікрон
- ↑ а б в https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/
- ↑ Tracking SARS-CoV-2 variants. www.who.int (англ.). Архів оригіналу за 9 червня 2021. Процитовано 1 червня 2021.
- ↑ Rosa-Aquino, Matt Stieb, Paola (21 березня 2021). Everything We Know About the Coronavirus Variant Spreading in New York City. Intelligencer (амер.). Архів оригіналу за 10 квітня 2021. Процитовано 10 квітня 2021.
- ↑ Mandavilli, Apoorva (24 лютого 2021). A New Coronavirus Variant Is Spreading in New York, Researchers Report. The New York Times (амер.). ISSN 0362-4331. Архів оригіналу за 26 квітня 2021. Процитовано 10 квітня 2021.
- ↑ outbreak.info. outbreak.info (англ.). Архів оригіналу за 22 квітня 2021. Процитовано 10 квітня 2021.
- ↑ PANGO lineages Lineage B.1.526. cov-lineages.org. 22 квітня 2021. Архів оригіналу за 22 квітня 2021. Процитовано 22 квітня 2021.
- ↑ Tracking SARS-CoV-2 variants. www.who.int (англ.). Архів оригіналу за 9 червня 2021. Процитовано 1 червня 2021.
- ↑ SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions. CDC.gov. Centers for Disease Control and Prevention. Архів оригіналу за 16 червня 2021. Процитовано 5 липня 2021.
- ↑ Corum, Jonathan; Zimmer, Carl. Coronavirus Variants and Mutations. The New York Times (амер.). ISSN 0362-4331. Архів оригіналу за 30 листопада 2021. Процитовано 10 квітня 2021.
- ↑ West, Anthony P.; Barnes, Christopher O.; Yang, Zhi; Bjorkman, Pamela J. (23 лютого 2021). SARS-CoV-2 lineage B.1.526 emerging in the New York region detected by software utility created to query the spike mutational landscape. bioRxiv (англ.): 2021.02.14.431043. doi:10.1101/2021.02.14.431043. PMC 8077570. PMID 33907745. Архів оригіналу за 3 грудня 2021. Процитовано 5 лютого 2022.
- ↑ SARS-CoV-2 sequences by variant, Jul 26, 2021, USA [Архівовано 2 грудня 2021 у Wayback Machine.] Our World in Data
- ↑ GISAID - hCov19 Variants. www.gisaid.org. Архів оригіналу за 23 червня 2021. Процитовано 2 липня 2021.
